全国政协委员、上海教科院副院长胡卫在针对“健全科研经费管理制度”提出的提案中指出，财政性科研经费近年大幅增加，使我国成为世界第二大研发投入国，但科研经费使用的合理性及效益问题日益突出，主要表现在:原创性成果较少，基础研究水平总体上与发达国家存在较大差距；科研经费浪费严重、使用混乱，科研资金用于项目本身仅占40％左右；高校腐败频发，在科研项目立项、经费使用管理、项目审查监管等环节缺乏必要的规范和约束。

　　胡卫建议，首先要完善科研经费使用办法，从项目直接成本中开支科研人员的薪金报酬。目前大多数科研项目中没有劳务费支出项目，不允许课题组发放劳务费，项目组人员不能获取津贴、补助，无法真正体现劳动投入，单靠工资收入的科研人员将很难维持有尊严的科研生涯。在此情况下，课题组寻找其他变通的途径来获得补偿，将模糊性较强、外部难以监督的支出项目扩大并转化为人员报酬，出现人力成本补偿“票据化”，大量“办公用品”、“交通费”、“餐饮费”等支出项目就相当于科研人员的变相报酬。

　　其次，要健全科研经费监管制度，应进一步强化科研负责机构的监管主体责任，严格外拨经费审核，执行政府采购制度，建立银行卡支付制度，加强内部审计，聘请第三方审计机构抽查，推进财务信息公开，增强经费使用的透明度。

　　同时，应建立问责惩戒机制和经费绩效评价机制，对于管理制度不健全、出现重大管理失误的科研申报单位，应视情节轻重，采取约谈警示、暂停项目经费拨付、限制项目申报资格等处罚，建立科学有效的经费绩效评价机制，引入第三方监督评价机构，全程对科研过程和成果进行考评，根据结果对课题经费适当调整。