建立新型农村合作医疗制度，是实践三个代表重要思想和贯彻党中央国务院《关于进一步加强农村卫生工作的决定》的直接体现。目前安徽省已有10个县市在进行这方面的试点。从我们对部分试点县市的追踪调查来看，新型农村合作医疗制度得到了广大农民的欢迎，被农民朋友誉为党和政府的一项德政工程。但这项制度要想真正落实，使更多的农民得到实惠，还有一些问题需要解决。
一是各级财政分担的资助金要提高标准。按规定，地方财政承担的10元钱按省市县3：2：5的比例分担，对于发达地区来讲，这个比例不成问题。但对不发达地区特别是贫困地区而言，县级财政多为“吃饭财政”，财力十分有限，因此这一比例到了市县这一级落实有难度，有的市只承诺不兑现应付的比例，把难题都交给了县里。不少试点地区希望中央财政能进一步提高补助标准，省市县三级财政的分担比例应按从大到小调整为5：3：2。中央财政的补助标准不提高，省市县分担比例不调整，这一制度在不发达的贫困县便很难实施到位。安徽省岳西县作为试点县，其财政收入管吃饭都不够，有些农民连10元钱的医保金都没法交，该县为了搞好试点，只好拿扶贫资金来交县级财政分担的部分，另外又通过全县各级干部捐款10万元、单位捐款6万元来帮助贫困的参保农民缴纳10元钱的入保金。这种情况搞一两次可以，长期搞肯定不行。
二是医疗基金在监督管理上要进一步完善。目前各试点县都设立了基金管委会与监管会，其成员主要来自本县县级机关、县直机关，以及农民代表，因此这种监督主要是自我监督。建议在自我监督的同时，还应实行自上而下的监督，以确保医疗基金准确发放、不被挪用。
三是农村医疗机构存在设备陈旧、人才严重不足的问题。据了解，目前很多乡镇卫生院设备十分陈旧，有的卫生院几十年没有更新设备。在安徽一个县里，全县28个乡镇卫生院没有一个本科生毕业生，绝大多数人只有中专学历，有的甚至只有初中水平。在农村实行医保必须解决两个问题：一是农民有钱看得起病，二是有农民可以去看病治病的医院。现在新型农村医疗合作制度的实施，在某种程度上解决了第一个问题，但没有解决第二个问题。因此要真正实施农村医保，在为农村解决医疗费问题的同时，国家必须加大农村医疗机构的资金投入与人才投入，否则农民还是很难享受医保的好处。
四是要防止补偿难、转院难的问题，防止借医保搞医疗垄断与地方保护。由于这一制度还在试点，目前试点县在补偿兑付方面还比较及时，以后随着这一制度的全面实施，能否及时补偿兑付很难说。另外，在确定医保定点医院方面，有的县能充分尊重入保农民的自己选择，但有的地方为了“肥水不流外人田”，强行规定入保农民的就医医院，保护本县医院的利益。县里为了减少补偿金，重病农民在转院方面申请时往往会遇到难题。这些问题不解决，新的制度可能会带来新的“看病难”，这是需要特别注意的。
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